https://www.ap-siken.com/s/kakomon/27_haru/pm07.html

上記問題の設問2(1)の解答は20000となっていますが、19999ではない理由を教えていただきたいです。

19999だと思った根拠ですが、問題文中に
「・・・カウント値が0になるとCPUに割込みを発生させる。・・・」
という記述があるためカウント値に0を含めるものとして、19999～0で20000(20ミリ秒)のカウントと考えたからです。

これに沿って考えた場合、解答の20000だとカウント値0を含めて合計20001カウントになってしまいませんか？

カウント値が0になった際に割り込みが発生するという事で
「→」１個が1マイクロ秒としますと

カウント値が1だと、1→0で割り込み発生となり、1マイクロ秒
カウント値が2だと、2→1→0で割り込み発生となり、2マイクロ秒
・
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カウント値が20000で、20000→・・・→1→0で割り込み発生となり、20000マイクロ秒(20ミリ秒)
になるかと思います。

カメラについてるタイマー撮影で考えてみましょう。
3,2,1,パシャ です。
3,2,1,0 パシャ ではありません。

いかがですか？

指摘していただいた通り、カウントダウンのタイミングと割込み発生のタイミングの区別ができていませんでした。
お二方ともありがとうございます。